Development of New Non-Ewald Method in Molecular Dynamics Calculation
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Iterative Force-Field Calculation and Molecular Dynamics of Cyclooctanone
Body's iterative force-field computer program has been used to calculate strain energies in cyclooctanone (I). 348 MHZ 1H NMR spectra of (I) have been investigated over the temperature range of 25° to -160°C. Two conformation processes affect the 1H NMR spectrum of (I). Iterative force-field calculations on the conformations and conformational interconversion paths of ...
متن کاملThermal conductivity calculation of magnetite using molecular dynamics simulation
In the current research, thermal conductivity of magnetite (Fe3O4) has been calculated using molecular dynamic simulation. The rNEMD Molecular Dynamics Method provided in the LMMPS package is used for the simulation of the thermal conductivity. The effects of magnetite layer size and temperature on the thermal conductivity have been investigated. The numerical results have...
متن کاملAmbient-Potential Composite Ewald Method for ab Initio Quantum Mechanical/Molecular Mechanical Molecular Dynamics Simulation.
A new approach for performing Particle Mesh Ewald in ab initio quantum mechanical/molecular mechanical (QM/MM) simulations with extended atomic orbital basis sets is presented. The new approach, the Ambient-Potential Composite Ewald (CEw) method, does not perform the QM/MM interaction with Mulliken charges nor electrostatically fit charges. Instead the nuclei and electron density interact direc...
متن کاملdevelopment of feminist poetics in adrienne rich
اشعار ریچ، به عنوان اشعاری که همیشه در حال تغییر و دگرگونی هستند، تجسمی از رشد و دگرگونیِ انسان هستد. پایان نامه ی حاضر، با تمرکز بر روی مراحل سیر شعری ریچ از تغییری در دنیا به عکس هایی فوری از یک عروس، سپس به شیرجه به درون کشتی شکسته و در نهایت به صبری عجیب مرا تا اینجا آورده، به بررسی این مراحل در قالب نظر شوالتر در رابطه با سه مرحله ی پیشرفت ادبی زنان یعنی مرحله ی زنانه، زن گرا و زن محور می پ...
15 صفحه اولAn efficient parallel implementation of the smooth particle mesh Ewald method for molecular dynamics simulations
This paper focuses on the implementation and the performance analysis of a smooth particle mesh Ewald method on several parallel computers. We present the details of the algorithms and our implementation that are used to optimize parallel efficiency on such parallel computers. © 2007 Elsevier B.V. All rights reserved. PACS: 02.70.Ns; 07.05.Tp
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Seibutsu Butsuri
سال: 2015
ISSN: 0582-4052,1347-4219
DOI: 10.2142/biophys.55.037